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Videometer MR植物根系原位監(jiān)測(cè)系統(tǒng)
Videometer MR植物根系原位監(jiān)測(cè)系統(tǒng)

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丹麥

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北京博普特科技有限公司

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根系是植物的重要組成部分,植物吸收土壤中的水分與養(yǎng)分全依賴根系,所以根系的研究對(duì)于植物各學(xué)科來說都至關(guān)重要,根系是陸地生態(tài)系統(tǒng)“隱藏的一半”,而且是動(dòng)態(tài)生長(zhǎng)的,對(duì)其進(jìn)行準(zhǔn)確取樣、觀察和測(cè)定存在一定困難。所以,根系研究方法的選擇,相對(duì)于對(duì)地上部分而言對(duì)研究結(jié)果具有更大的影響。丹麥Videometer公司開發(fā)的根系多光譜原位監(jiān)測(cè)系統(tǒng)是一款先進(jìn)的根系多光譜測(cè)量系統(tǒng),整體性能指標(biāo)處于先進(jìn)水準(zhǔn),已經(jīng)在丹麥歌本哈根大學(xué)使用并取得了成績(jī)。

廣大科研工作者為了研究根系,應(yīng)用了很多方法,從傳統(tǒng)的挖掘法、根鉆法、玻璃壁法、容器法等等,到現(xiàn)代的根窗法、微根管法等等,取得了很多科研成果。隨著科技的發(fā)展,越來越多的現(xiàn)代高精尖技術(shù)應(yīng)用到根系研究中來,多光譜成像技術(shù)就是其中一種,它集光譜和圖像為一體,含有海量的光譜信息和空間信息,這些信息體現(xiàn)了植物各種器官、組織的諸多表型特性,該技術(shù)圖譜合一的特性使其在根系表型方面具有較大潛力。

丹麥Videometer公司開發(fā)的根系多光譜原位監(jiān)測(cè)系統(tǒng),是做根系研究的革新性專業(yè)裝備,無論對(duì)于淺根系蔬菜還是淺根系喬木,都具有現(xiàn)實(shí)性研究意義。目前在根系研究領(lǐng)域中,對(duì)于玉米根系和小麥根系所作的研究比較多,但大多還采用傳統(tǒng)不可重復(fù)的挖掘方法。植物根系原位監(jiān)測(cè)儀的出現(xiàn),改變了這種情況,使得植物研究人員在對(duì)根系進(jìn)行研究的過程中,可以使用原位的方式,無損傷的進(jìn)行監(jiān)測(cè)。

根系是植物主要吸水、營(yíng)養(yǎng)物等器官,通過對(duì)根系監(jiān)測(cè)和研究,能優(yōu)化水肥方案,促進(jìn)農(nóng)作物、林業(yè)等產(chǎn)業(yè)增產(chǎn)增效,有利于土地荒漠化治理、土壤修復(fù)等。但長(zhǎng)期以來,對(duì)根系研究主要是采用挖掘法、土鉆法、土柱法、容器法、剖面法等傳統(tǒng)方法,采樣破壞性大、工作量大,嚴(yán)重阻礙了根系研究的深入開展。《科學(xué)》雜志曾出版專輯認(rèn)為,“人類對(duì)自己腳下土壤的了解遠(yuǎn)遠(yuǎn)不及對(duì)宇宙的了解”,更是佐證了地下生態(tài)學(xué)研究難度之大。因此,對(duì)根系研究方法的選擇和改進(jìn),對(duì)科研結(jié)果影響巨大。

丹麥根本哈根大學(xué)科學(xué)家等利用多光譜成像系統(tǒng)對(duì)植物植株、根系進(jìn)行成像研究,取得了前瞻性的成果。

該研究以深根系大麥為研究對(duì)象,將大麥下方埋了有3m長(zhǎng)的微根管,使用Videometer公司的Videometer MR多光譜成像系統(tǒng),定期通過根窗透明面對(duì)根系成像分析。原始光譜圖像經(jīng)過Videometer自帶軟件一系列算法處理后得到目標(biāo)根系圖像,隨后進(jìn)行閾值分割、模糊聚類等模型分析,得到根系的形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)。

傳統(tǒng)的RGB可見光成像技術(shù)是利用顏色識(shí)別根系,前提是根系和土壤之間要有比較明顯的色差,但實(shí)際根系生長(zhǎng)在土壤中,顏色差異并不明顯,這樣根系識(shí)別可能會(huì)造成比較大的誤差,RGB可見光成像技術(shù)使用就會(huì)受限。歌本哈根將多光譜成像技術(shù)和傳統(tǒng)的RGB成像技術(shù)進(jìn)行了對(duì)比,顯示多光譜成像技術(shù)基于光譜特征在根系識(shí)別上的明顯優(yōu)勢(shì),并且對(duì)多光譜成像另一項(xiàng)先進(jìn)的功能進(jìn)行了初步探討——即光譜特征對(duì)于根系生化特性的識(shí)別(例如細(xì)根發(fā)生、成熟、衰老、死亡的周轉(zhuǎn)過程;例如根際分泌物成分的變化等),顯示了多光譜成像技術(shù)在根系研究領(lǐng)域的巨大潛力。

產(chǎn)品介紹

隨著人們對(duì)植物各組織研究的深入,一些疑難問題也漸漸顯現(xiàn)出來。例如,人們研究植物根系時(shí),會(huì)遇到很多困難。傳統(tǒng)的洗根掃描法確實(shí)能夠清晰地將根系展現(xiàn)在人們眼前,但卻破壞了其原有的狀態(tài);微根窗法能夠解決原位測(cè)量的問題,但卻不能探索土壤內(nèi)部的根系分布;因此如何能夠原位觀測(cè)土壤中的根系變化成了阻撓廣大科研工作者的難題。目前世界上盡管田間植物表型研究技術(shù)有巨大進(jìn)展,但是還幾乎沒有可以高通量的對(duì)植物根系進(jìn)行原位高通量研究的系統(tǒng)。為解決這些難題,丹麥多光譜儀器生產(chǎn)商Videometer推出了專門用于植物研究的高通量多光譜根系成像系統(tǒng),可對(duì)土壤中的植物根系進(jìn)行成像分析,無需專業(yè)的圖像處理知識(shí),可獲取形態(tài)學(xué)以及內(nèi)部性狀信息。

Radimax設(shè)施由4個(gè)獨(dú)立共計(jì)400m2的獨(dú)立區(qū)塊組成,配有移動(dòng)防雨罩,復(fù)雜的地下供水系統(tǒng)以及每個(gè)區(qū)域配有150個(gè)固定安裝的根管組成,Videometer設(shè)計(jì)了移動(dòng)式半自動(dòng)多光譜相機(jī)系統(tǒng),相機(jī)可以沿著根管接口移動(dòng),高速拍攝,可以同時(shí)研究在3m深度處研究多達(dá)150個(gè)不同根管,了解根生長(zhǎng)情況。RadiMax 項(xiàng)目致力于研發(fā)深根植物特征、改善植物耐寒性能。研究將利用較新構(gòu)建的根系表型成像系統(tǒng)Radimax來進(jìn)行地上和地下植物根系干旱表型反應(yīng)分析。Radimax是一款獨(dú)特的高通量根系成像系統(tǒng),采用了較新的生物圖像分析以及數(shù)學(xué)建模技術(shù)。利用該設(shè)施以及數(shù)字統(tǒng)計(jì)方法,可以利用所獲得多個(gè)組學(xué)數(shù)據(jù)(基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)以及表觀基因組學(xué))用以研究作物中干旱反應(yīng)的基因結(jié)構(gòu)。其中主要應(yīng)用之一是研究作物中的與非生物脅迫相關(guān)的表觀基因組分析。

Radimax研究人員以及Videometer公司,團(tuán)隊(duì)由具有表觀基因?qū)W和統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)背景的跨學(xué)科人員組成,團(tuán)隊(duì)成員了解植物培育、具備基因組和表型組數(shù)據(jù)集集成分析能力,可從系統(tǒng)角度研究作物中的復(fù)雜性狀結(jié)構(gòu)。

Copenhagen表型平臺(tái)主要采用了Videometer公司的多光譜成像系統(tǒng)。

田間表型成像系統(tǒng)組成如下:移動(dòng)小車載多光譜相機(jī)系統(tǒng)和處理軟件、根管等。系統(tǒng)采用工程設(shè)計(jì)理念,在設(shè)計(jì)構(gòu)建時(shí)就要考慮整合。

主要特點(diǎn)

積分球提供均勻和彌散光線照明

5-10秒鐘內(nèi)實(shí)現(xiàn)光譜成像和定量分析

19-20 種不同波長(zhǎng)/光源

多光譜熒光備選

6 或9.1 百萬像素/波長(zhǎng)提供 1.2-3.6億像素 /幀分辨率

標(biāo)準(zhǔn)設(shè)備包括易于使用的設(shè)備校準(zhǔn)

與傳統(tǒng)RGB技術(shù)相比具有**的彩色測(cè)量功能

根據(jù)應(yīng)用需求可自動(dòng)切換動(dòng)態(tài)范圍

光源壽命長(zhǎng)、可達(dá)10萬小時(shí)

獨(dú)特LED光源技術(shù)穩(wěn)定性增強(qiáng)

前光燈和背光燈組合、備選背光燈

相對(duì)樣品自動(dòng)移動(dòng)照明

強(qiáng)大探索軟件

常規(guī)應(yīng)用配方構(gòu)建工具(建模)

技術(shù)參數(shù)

全套分析時(shí)間:5-10秒/樣品

電源:100 -240 V AC, 50/60 Hz

電源功耗:300 VA

環(huán)境溫度:操作: 5 - 40℃,儲(chǔ)存;-5 -50℃

環(huán)境濕度:20-90 % RH相對(duì)濕度,非冷凝

PC 要求:*低配置: Intel i7 或更佳, 16GB RAM, USB2 端口, USB3超速端口

軟件要求:Microsoft Windows 7/8.1/10 Professional,l 64 bit, 新windows 版本

硬件備選:暗場(chǎng)/明場(chǎng)背光 ;濾波輪 (用于熒光)

軟件備選:圖像處理工具包 (IPT) ;光譜成像工具盒 (MSI) ;斑點(diǎn)工具盒

Videometer系列多光譜成像系統(tǒng)廣泛應(yīng)用于:植物/作物表型組學(xué)研究分析;根系分析;作物育種與種子品質(zhì)檢測(cè);植物/作物脅迫生理響應(yīng);作物病理學(xué)分析與病原檢測(cè);食品檢測(cè);中藥成分分析與品質(zhì)檢測(cè)。來自哥本哈根大學(xué)、丹麥理工大學(xué)以及丹麥Videometer公司的專家在剛剛利用該設(shè)備在Plant and Soil上發(fā)表了題為A multispectral camera system for automated minirhizotron image analysis的文章,早些利用該設(shè)備進(jìn)行研究的文章題為Frontiers in Plant Sciences,Screening of Barley Resistance Against Powdery Mildew by Simultaneous High-Throughput Enzyme Activity Signature Profiling and Multispectral Imaging。

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