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數字PCR(Digital PCR,dPCR)是一種核酸分子絕對定量技術,它通過直接計數DNA分子的個數來實現對起始樣品的絕對定量。
作為基于微流控的新一代PCR技術,這三點優勢讓它能在一眾PCR檢測手段中突出重圍。
絕對定量:
數字PCR能夠直接數出DNA分子的個數,實現對起始樣品的絕對定量,避免了傳統定量PCR中相對定量的局限性。
高靈敏度:
數字PCR能夠檢測出低頻率的突變和表達變化,提高了檢測的靈敏度和準確性。
可靠性:
數字PCR采用統計學原理進行數據分析,能夠降低實驗誤差和假陽性率,提高結果的可靠性。
從實驗流程上看,數字PCR檢測可分為以下四個步驟:
圖一:數字PCR檢測標準流程展示
隨著檢測通量以及實驗樣本處理方式的復雜度持續升級,體系制備成為了讓科學家們頭疼的難題,主要體現在體系配置工作量大,手工重復性差,前處理耗時長等。
為幫助科學家們在體系配置上的難題,小貝為科學家們推薦一款輔助工具——Biomek i系列自動化移液工作站。
自動化ddPCR(微滴式數字PCR)體系配置
高通量處理:
自動化ddPCR系統能夠一次性處理大量樣本,大大提高了實驗通量,減少了人工操作的時間和誤差。
圖二:以多重數字PCR檢測重組腺相關病毒(rAAV)病毒基因組拷貝數實驗流程為例,1小時可完成6*96個待測樣本的體系配置。
降低人工成本:
自動化ddPCR系統可以減少對專業操作人員的依賴,降低人工成本。
圖三:自動化軟件dPCR全流程自動化程序展示。標準化實驗流程,全自動化完成,無需人員進行實驗操作
結果保障:
可重復性,精確度高,穩定的結果輸出。
圖四:圖A為自動化標準品梯度稀釋試驗,結果表明定量限可低至 20 拷貝/反應,檢測限可至 5~10 拷貝/反應,ddPCR 方法能更好的用于標準品的定量和殘留檢測。
圖B為 AAV 基因組滴度檢測的代表性圖譜,通過對 自動化AAV 樣品的前處理,再通過 ddPCR 系統進行液滴生成并進行 PCR 擴增后讀取液滴信號,結果表明使用 ddPCR 對病毒滴度進行檢測,其結果陰陽性區分明顯,易于分析,結果準確,并且相同樣品不同天檢測 CV 值 ≤10%。
未來數字PCR可拓展的應用領域:
精準醫學:
數字PCR在精準醫學領域的應用將進一步拓展,包括基因表達差異研究、拷貝數變異(CNV)研究、腫瘤治療的伴隨診斷等。通過數字PCR技術,可以實現對基因表達的精確定量,為疾病的診斷和治療提供有力支持。
環境監測:
隨著全球對生物安全和環境保護的重視,數字PCR在環境監測領域的應用也將逐漸增多。通過數字PCR技術,可以檢測和監測環境中的致病微生物和污染物,為環境保護和公共衛生安全提供重要保障。
農業遺傳改良:
在農業領域,數字PCR技術可以用于農作物基因變異的檢測和分析,為育種工作提供有力支持。通過數字PCR技術,可以更加精確地檢測和分析農作物中的基因變異,為培育高產、優質、抗病的農作物品種提供技術支持。
貝克曼庫爾特生命科學提供專業的軟件硬件支持,以及客戶應用開發來滿足大家對于生命科學自動化的需求。
關于貝克曼自動化整合部門介紹:
1 貝克曼庫爾特生命科學自動化整合部門位于美國Indianapolis,該部門位于Beckman質量管理系統下,并經過ISO9001認證,部門配備整合實驗室,完成整合設備的研發。
2 整合部門人員包含機械、電子、軟件、系統工程師,和工程師支持、項目管理人員。人員配備齊全,售前售后響應快速。
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