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歐盟**的農業生物科技公司——荷蘭KeyGene公司,是一家專注于提供基因型-表型分析和性狀及關聯基因挖掘服務的公司。自從2011年由KeyGene公司和德國LemnaTec共同建立的歐洲植物表型平臺PhenoFab投入運轉后,迅速積累了大量的基因型-表型測量和分析經驗,并取得了異常出色的結果,從而導致PhenoFab一直處于滿負荷運轉狀態。
基于大量的PhenoFab使用經驗和數據分析的基礎,KeyGene研發出了一款國際上*小的便攜式植物表型平臺KeyBox。
考慮到KeyBox可能需要經常帶到溫室、野外或其它地方進行測量,因此它被設計成可快速拆卸、打包的樣式。將KeyBox打包后,就成為一個拉桿箱,方便運輸和攜帶。
折疊前 折疊后
技術路線
操作軟件
KeyBox的工作軟件Pheno-suite由KeyGene公司強大的生物信息學和軟件團隊開發,充分考慮在實際應用的需求,操作簡單,功能強大。
Pheno-suite的工作模塊包括:
l 基礎整合模塊。內置在軟件中,是軟件的基本組成部分。
l 選配模塊。功能強大,針對應用的每個算法是一個模塊,客戶可以根據需求選配。
基礎整合模塊 | 功能強大的選配模塊 |
l 顏色校準 Color correction | l 種子萌發測量 Seed germination in tray KeyGene在不斷的研究新算法,新模塊出來后可以付費升級。 |
應用實例
1、下圖中,利用KeyBox測量了辣椒的像素大小和破損部位的像素大小,這樣就得出了辣椒的破損程度。
2、 下圖中,利用KeyBox測量了甜瓜的像素大小、黑點的像素大小,得出黑點的占比。還測量了甜瓜的圓度。
3、下圖中,利用KeyBox測量了一個葉片的尺寸和形態參數。
4、下圖中,利用KeyBox測量了一個104孔的芽盤中,種子的萌發情況,精確識別萌發的種子和未萌發的種子,計算出萌發率。
5、下圖中,利用KeyBox研究了擬南芥野生型和突變株對霉病的抗性,精確計算出病變部位的像素大小。
主要功能l對植物體進行整株或器官(果實、種子、根系、葉片、幼苗等) 的表型成像 l 便攜可折疊式設計,方便帶到溫室或野外使用 l 標準光照環境,數據可重復 l 經驗豐富的專家根據應用經驗設計的軟件,操作簡單,解決農業應用中遇到的問題 l 內置顏色校正和讀取電子標簽的程 l 可選一系列的功能程序模塊,并不斷升級中 | 應用領域l 表型性狀分析/挖掘,基因型-表型關聯 l 農業育種 l 園藝學、農業信息學 l 果實品質分析 l 植物病理研究 l 生物量分析 l 種子萌發研究 l 抗逆研究 |
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